126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4083 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  413  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4185  TetR family transcriptional regulator  97.04 
 
 		 203 aa  400  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  97.04 
 
 		 203 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0174  TetR family transcriptional regulator  97.04 
 
 		 203 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3546  TetR family transcriptional regulator  92.12 
 
 		 203 aa  377  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0172  TetR family transcriptional regulator  75.86 
 
 		 203 aa  309  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0172  TetR family transcriptional regulator  76.85 
 
 		 203 aa  308  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.194351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0167  TetR family transcriptional regulator  75.37 
 
 		 203 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.266146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0193  TetR family transcriptional regulator  75.37 
 
 		 203 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0121  putative transcriptional regulator, TetR family protein  54.77 
 
 		 204 aa  202  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.778342  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0132  TetR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0186  TetR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.240473 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01438  hypothetical protein  37.11 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004024  transcriptional regulator  37.24 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1551  hypothetical protein  37.44 
 
 		 196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.494685  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1003  putative HTH-type transcriptional regulator  40.34 
 
 		 199 aa  118  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3021  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0676  putative transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0734  putative transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1500  regulatory protein TetR  29.48 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.570959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1779  regulatory protein TetR  29.48 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1501  regulatory protein TetR  28.32 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856799  normal  0.774912 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0668  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109249  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1636  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  28.98 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1605  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72373  hitchhiker  0.0000763584 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  25.26 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4515  transcriptional regulator, TetR family  25.96 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  22.75 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 216 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4581  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0138954  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1203  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  24.48 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  23.15 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  22.91 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 237 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 236 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2288  regulatory protein, TetR  31.58 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  22.91 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 184 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  24.4 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 239 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0267  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.700682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  19.8 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  29.46 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  27.27 
 
 		 510 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 254 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4101  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>