More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1741 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 307 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  67.64 
 
 		 333 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  65.4 
 
 		 248 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 204 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  47.32 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  40.18 
 
 		 200 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 202 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 203 aa  96.3  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 215 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.44 
 
 		 207 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 208 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 199 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  42.86 
 
 		 199 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 203 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 		 197 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  41.12 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 219 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  41.07 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 215 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  39.84 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 215 aa  67  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 210 aa  67  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 195 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  38.94 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  31.53 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  31.53 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 214 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 208 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  35.71 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  26.51 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  36.63 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  43 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  24.53 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  24.9 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  29.73 
 
 		 190 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  24.15 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 203 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  28.5 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 212 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 98 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0855  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  41 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 202 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 226 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  28.1 
 
 		 200 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 244 aa  57  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 223 aa  57  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1838  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1609  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 239 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 212 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>