238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0655 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  504  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  54.4 
 
 		 195 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  40.74 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  36.13 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  38.39 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  38.63 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  37.05 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  38.79 
 
 		 216 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 249 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 244 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  33.19 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  36.74 
 
 		 224 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  39.09 
 
 		 228 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 226 aa  99  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 247 aa  98.6  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 261 aa  95.9  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 241 aa  95.9  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 234 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  31.96 
 
 		 227 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  32.88 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 229 aa  93.2  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 225 aa  92  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  32.71 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  28.76 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  34.38 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  30.21 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  44.04 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  33.81 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  30.24 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  33.48 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  29.5 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  28.05 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  27.8 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  43.28 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 222 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 210 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  39.6 
 
 		 224 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 224 aa  52  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 222 aa  52  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 193 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 194 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1257  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1274  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.941811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1283  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20735  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>