More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3766 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
237 aa  478  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
261 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  40.17 
 
 
260 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  39.21 
 
 
239 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  42.92 
 
 
260 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  38.63 
 
 
250 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  39.09 
 
 
248 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  40.49 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  37.76 
 
 
242 aa  140  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
244 aa  138  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
232 aa  131  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 
283 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  33.48 
 
 
246 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 
227 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  35.81 
 
 
241 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  34.89 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 
236 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
249 aa  111  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
235 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 
241 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 
261 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 
221 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  33.47 
 
 
255 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  31.7 
 
 
260 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 
227 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 
216 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 
195 aa  102  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 
276 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
232 aa  98.6  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  31.3 
 
 
230 aa  98.6  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
243 aa  96.3  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 
229 aa  92.8  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
236 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
217 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
217 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
226 aa  89  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  29.57 
 
 
234 aa  87  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 
224 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 
244 aa  85.9  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  28.43 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  29.05 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  29.79 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  37.82 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  28.36 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  24.12 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
191 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
257 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 
222 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 
197 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
208 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
195 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  34.65 
 
 
196 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 
209 aa  52  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  38.04 
 
 
184 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 
212 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
267 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 
208 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
211 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
219 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4101  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
204 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 
193 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 
183 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
234 aa  49.7  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
208 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  23.48 
 
 
248 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
218 aa  49.3  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 
196 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  23.48 
 
 
259 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 
231 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  38.16 
 
 
228 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 
193 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
228 aa  48.5  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  35.38 
 
 
248 aa  48.5  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
182 aa  48.5  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
208 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  30.84 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0657  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
205 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.184165  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  28 
 
 
197 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
209 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
200 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>