276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35360 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  507  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  40.43 
 
 		 239 aa  181  9.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  38.63 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 261 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 244 aa  148  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  32.07 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 232 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  29.18 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  30.19 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 283 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  26.89 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  31.9 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  26.27 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  34.23 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  24.03 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  31.51 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 191 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 200 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 203 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  34.69 
 
 		 204 aa  52  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2063  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 208 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 209 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 216 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 209 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 203 aa  48.9  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 208 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6854  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.101929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 181 aa  48.5  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2016  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 194 aa  48.5  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  23.93 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 188 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 183 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 180 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.33 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.33 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.33 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  24.46 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.33 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.33 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>