80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2845 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  53.11 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  42.92 
 
 		 237 aa  175  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  42.41 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  40.42 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  33.91 
 
 		 239 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  38.62 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  32.34 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  33.48 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 260 aa  105  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  33.2 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 240 aa  99  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 234 aa  95.9  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 254 aa  95.5  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  32.33 
 
 		 230 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 241 aa  92.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  33.19 
 
 		 241 aa  92  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 235 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 232 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 224 aa  89  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 247 aa  89  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  30.58 
 
 		 234 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 226 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 217 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 217 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  30.74 
 
 		 221 aa  85.1  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 276 aa  78.6  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  28.19 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  30.45 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  35.51 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  34.71 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  27.67 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  24.15 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  24.62 
 
 		 199 aa  48.9  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 208 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  25 
 
 		 227 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 229 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  26.32 
 
 		 199 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 196 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4101  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 224 aa  42.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 205 aa  42.7  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  37.04 
 
 		 228 aa  42.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 233 aa  42.4  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 225 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1515  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 219 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 194 aa  42  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>