96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16600 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 250 aa  181  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  39.21 
 
 		 237 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  34.89 
 
 		 260 aa  141  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  35.5 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 283 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  32.77 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 234 aa  92.8  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 254 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  29.44 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  25.1 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  27.07 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  25.55 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 195 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  25.74 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  23.71 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  25.55 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  26.4 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  30.63 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  27.86 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4101  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 191 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 333 aa  45.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 307 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  20.89 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 206 aa  45.4  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 222 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 219 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1515  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  24.8 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1711  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.678609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  30.48 
 
 		 252 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  24.61 
 
 		 196 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 194 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  24.79 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  25.42 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 203 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 187 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 174 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 220 aa  42.4  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 183 aa  42  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  29.07 
 
 		 194 aa  42  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  25.45 
 
 		 205 aa  42  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0384  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 225 aa  42  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 218 aa  42  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 202 aa  42  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>