More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1425 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  423  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  30.69 
 
 		 199 aa  111  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  32.54 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  39.17 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 248 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  34.21 
 
 		 184 aa  99.4  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 307 aa  92  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 333 aa  91.7  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 203 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 230 aa  84.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  25.96 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 215 aa  72  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  36.11 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  32.39 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  27.37 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 249 aa  61.6  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  26.25 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3546  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  26.04 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1551  hypothetical protein  27.59 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.494685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004024  transcriptional regulator  24.59 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  28 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>