119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11846 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  64.91 
 
 		 236 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  61.23 
 
 		 226 aa  281  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 217 aa  257  9e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 217 aa  257  9e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  61.93 
 
 		 217 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  52.34 
 
 		 230 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  45.89 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  46.29 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  43.75 
 
 		 251 aa  168  7e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  46.73 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 278 aa  145  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  40.64 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  40.54 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  39.3 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  41.23 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  39.44 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  40.88 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  39.3 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 232 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 228 aa  98.6  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 249 aa  95.9  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 254 aa  95.5  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 261 aa  93.2  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 240 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 254 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 235 aa  85.5  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  32 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  27.8 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  25.74 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  31.9 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 191 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  25.22 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  26.72 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3217  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000141467  hitchhiker  0.00109998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  28.95 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  30.66 
 
 		 311 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  26.23 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 193 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 223 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  23.18 
 
 		 208 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 253 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 218 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 333 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  21.43 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  40.48 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 307 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>