More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4467 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  89.81 
 
 		 206 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  81.55 
 
 		 205 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  81.55 
 
 		 205 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  81.55 
 
 		 205 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  36.22 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0406  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10277  transcriptional regulator  29.23 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.133301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 242 aa  64.7  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  35.04 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  34.06 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  45.9 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  30.95 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 309 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  40.98 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1641  transcriptional regulator, TetR family protein  30.36 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.216203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 261 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 394 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  27.36 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 394 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 394 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 244 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>