152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5555 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 260 aa  528  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 261 aa  261  6.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  40.17 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  36.25 
 
 		 242 aa  142  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  40.71 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  34.89 
 
 		 239 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 244 aa  122  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 232 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 240 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 248 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  30.67 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 228 aa  99  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 249 aa  98.6  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 216 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 232 aa  89.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 241 aa  88.6  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 226 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  28.77 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  29.77 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  27.71 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  28.22 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  28.02 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  35.64 
 
 		 223 aa  62  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  22.81 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  31.15 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 333 aa  52.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2016  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  29.13 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4638  putative transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  31.15 
 
 		 196 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5887  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 212 aa  49.7  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 200 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 295 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 203 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0267  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.700682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 212 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 208 aa  48.9  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1711  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.678609 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  31.03 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 184 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 202 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1515  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2188  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 194 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106219  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  26.14 
 
 		 216 aa  45.8  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 203 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 248 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  36.67 
 
 		 510 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 200 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4101  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  37.68 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 184 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  23.58 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>