More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2539 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  90.82 
 
 		 196 aa  356  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  42.42 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  42.69 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  43.03 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  37.36 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  37.65 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 203 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 191 aa  98.2  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  32.64 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 204 aa  95.9  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  34.55 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 222 aa  95.5  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 208 aa  94.7  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 240 aa  93.2  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  92.4  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 184 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 211 aa  91.7  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  38.8 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  32.09 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 205 aa  85.5  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 199 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  32.62 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  31.49 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4769  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  32.96 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4409  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 150 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  32.76 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4026  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62673  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2111  TetR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.0160657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 217 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
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NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  30.06 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  37.59 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
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NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
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NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
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NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  33.72 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
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NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
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NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  32.97 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
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NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_5208  hypothetical protein  51.19 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0482402 
 
 
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NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
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NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  30.86 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
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NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
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