More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3222 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
204 aa  407  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  66.83 
 
 
202 aa  264  8e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  60.2 
 
 
222 aa  223  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  45.78 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  36.98 
 
 
201 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  38.01 
 
 
203 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 
200 aa  104  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
208 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 
181 aa  99.8  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
202 aa  98.2  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  37.85 
 
 
190 aa  94  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
217 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  38.86 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
208 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 
199 aa  93.2  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
217 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
217 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  48.62 
 
 
222 aa  92  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
236 aa  89  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  39.11 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
237 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  50.47 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
236 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 
206 aa  84.7  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  42.64 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  44.14 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  45.05 
 
 
244 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  42.73 
 
 
234 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  42.73 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 
201 aa  79  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
225 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 
214 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  30.29 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  42.99 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  43.97 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  43.1 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  32.32 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
193 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  43.81 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  44.72 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  37.59 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  31.65 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00920  transcriptional regulator, tetR family  33.56 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  53.12 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
242 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
222 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
234 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
231 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  53.97 
 
 
197 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  28 
 
 
200 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 
191 aa  62.4  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  51.67 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4924  TetR family transcriptional regulator  44.76 
 
 
216 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0122195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 
229 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
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NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
195 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
225 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
219 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
216 aa  58.5  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
232 aa  58.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.375487 
 
 
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NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  30.77 
 
 
224 aa  58.2  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
195 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
195 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
150 aa  58.2  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335686 
 
 
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NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  33.64 
 
 
205 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
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NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
235 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.731504 
 
 
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NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 
238 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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