251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0845 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 188 aa  370  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  87.03 
 
 		 209 aa  262  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  59.2 
 
 		 181 aa  178  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 192 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 193 aa  135  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  45.88 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 184 aa  121  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 184 aa  121  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  40.72 
 
 		 225 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  42.77 
 
 		 190 aa  98.6  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 212 aa  98.2  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  39.02 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 206 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  41.67 
 
 		 206 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  41.72 
 
 		 222 aa  93.6  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  38.59 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  37.81 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 236 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 200 aa  89.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 204 aa  87.8  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 232 aa  87  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 202 aa  86.3  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 234 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 196 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 240 aa  85.9  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 203 aa  85.5  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 203 aa  85.5  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 211 aa  85.1  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 222 aa  84.7  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  31.91 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
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NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
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NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  44.72 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
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NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 237 aa  77.8  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  41.53 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  36.13 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  44.86 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 204 aa  72  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  36.57 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 239 aa  70.9  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  37.2 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1537  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313453  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  34.05 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
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NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2111  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.0160657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4924  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0122195 
 
 
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NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  51.47 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  26.58 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  33.87 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
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NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  24.4 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
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NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
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NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
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NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
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NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
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NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
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