More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0784 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 204 aa  85.5  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  34.34 
 
 		 201 aa  85.1  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 192 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 184 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  31.68 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  38.84 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  30 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  39.05 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 244 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  30.43 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  36.11 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  24.36 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  33.93 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 307 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 236 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
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NC_008577  Shewana3_0172  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.194351  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
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