More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2132 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  73.21 
 
 		 234 aa  341  7e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  50.22 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  47.37 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 212 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 203 aa  91.7  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 207 aa  85.1  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 295 aa  85.1  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 202 aa  72  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  32.51 
 
 		 216 aa  72  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  32.57 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  34.39 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  35.09 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 174 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  38.26 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  30.63 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  28.04 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4409  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  29.84 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  26.07 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  35.63 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  30.05 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>