More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0784 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  33.13 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  32.88 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  34 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  27.95 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  30 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6450  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6157  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  21.91 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  38 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  31.71 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 230 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0982  regulatory protein TetR  39.77 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 230 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  26.25 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  22.82 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  26.73 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4924  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0122195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0501  nucleoid occlusion protein  26.79 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.957497  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  26.8 
 
 		 237 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1203  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>