More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0782 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 295 aa  586  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  65.5 
 
 		 212 aa  248  9e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  47.74 
 
 		 197 aa  155  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 234 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 211 aa  95.9  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  30.12 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 222 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  43.69 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  43.43 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  28.9 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 203 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  30 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  32.4 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  32.72 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 200 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 333 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 180 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 194 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  26.26 
 
 		 190 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 203 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  28.43 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 195 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 211 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 222 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 216 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 221 aa  53.9  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 206 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 194 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  37.11 
 
 		 190 aa  53.5  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 246 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 246 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 258 aa  53.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 200 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 246 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 236 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 229 aa  53.1  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  31.01 
 
 		 241 aa  53.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 216 aa  53.1  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 216 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 222 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 241 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  52.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  52.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 197 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 225 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 225 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>