More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1375 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  100 
 
 		 199 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  45.73 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  44.39 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
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NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 248 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
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NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 193 aa  91.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 307 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 333 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 200 aa  84.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  32.14 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
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NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 195 aa  72  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
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NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
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NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
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NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
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NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 295 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
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NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
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NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  30.84 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  22.98 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  21.97 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  31.43 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  26.9 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0167  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.266146 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  20.51 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0676  putative transcriptional regulator, TetR family  22.67 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_0734  putative transcriptional regulator, TetR family  22.67 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522503  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
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NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0172  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_0172  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.194351  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
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NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  22.02 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
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NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  21.23 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
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