287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05540 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  396  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  52.04 
 
 		 217 aa  192  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  43.2 
 
 		 222 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  39.49 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 243 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  41.36 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  42.54 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 229 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  40.7 
 
 		 221 aa  94.7  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 226 aa  89.4  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 209 aa  84.7  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  32.61 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  35.76 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 167 aa  67  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  29.56 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  22.09 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  34.73 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  28.4 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0668  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109249  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  36.61 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3475  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0172  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.194351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0193  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  38.53 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0174  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 235 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 236 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 181 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  30.07 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4185  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  32.88 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  22.02 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0167  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.266146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 257 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3546  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>