More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4024 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 215 aa  141  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 203 aa  123  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 333 aa  118  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 307 aa  117  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 257 aa  109  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 215 aa  98.6  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  32.78 
 
 		 199 aa  95.5  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 214 aa  95.1  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  32.53 
 
 		 190 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 231 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  31.03 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  33.51 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  28.66 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  28.96 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  27.22 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  28.49 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  24.22 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  28.98 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1838  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_3546  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  36.89 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
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NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
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NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
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NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
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NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
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NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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