More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0868 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 230 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  44.03 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 		 217 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  40.48 
 
 		 197 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  38.79 
 
 		 222 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 193 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  35.88 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  40 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  35.59 
 
 		 196 aa  92.4  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  35.83 
 
 		 206 aa  90.1  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 195 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 195 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 195 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  36.53 
 
 		 208 aa  85.9  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 218 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  39.84 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 200 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  31.45 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  35.51 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  30.18 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  35.07 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 204 aa  62  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  33.63 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  25.17 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>