164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4671 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  91.26 
 
 		 206 aa  362  3e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  75.61 
 
 		 212 aa  309  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  71.36 
 
 		 221 aa  290  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  58.79 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  39.41 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  38.05 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 230 aa  101  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  38.29 
 
 		 232 aa  97.8  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 231 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  36.42 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  33.13 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  26.05 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  33.12 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  29.09 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  29.09 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  25.45 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  23.21 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 184 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 214 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  29.63 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 333 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  23.57 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  22.75 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 181 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 307 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 256 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 264 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  28.67 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  34.91 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 295 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>