143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0197 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  75.61 
 
 		 206 aa  309  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  75.61 
 
 		 206 aa  298  5e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  64.82 
 
 		 221 aa  265  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  56.13 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  40.94 
 
 		 232 aa  99.4  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 229 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  37.85 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 193 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  32.16 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  37.41 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  32.41 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  34.39 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  22.09 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  27.98 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  26.74 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3790  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  31.11 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  36.47 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 295 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 333 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  27.16 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 307 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 184 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 184 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 174 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  27.1 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  26.7 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  28.65 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 183 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1751  transcriptional regulator  32.71 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000599302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 192 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>