170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3105 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  37.28 
 
 		 203 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  32.43 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  30.99 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  31.74 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  31.58 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  34.65 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  33.06 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4924  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0122195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  30.32 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 244 aa  48.5  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 196 aa  48.5  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  24.57 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  31.19 
 
 		 241 aa  48.5  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  26.06 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  28.35 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  29.8 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>