More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1032 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
207 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  80.29 
 
 
206 aa  297  6e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  82.21 
 
 
206 aa  282  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  50.56 
 
 
186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  47.06 
 
 
190 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  44.97 
 
 
202 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  46.11 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  49.43 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  40.53 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  44.38 
 
 
224 aa  111  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  41.95 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  40.61 
 
 
196 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
204 aa  106  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
240 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  42.69 
 
 
196 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
222 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
208 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  45.09 
 
 
201 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
217 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
211 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  39.41 
 
 
236 aa  98.6  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
217 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
217 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  42.94 
 
 
191 aa  98.6  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
203 aa  98.2  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 
184 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 
184 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
184 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
239 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 
212 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  39.41 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
208 aa  92.8  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 
195 aa  91.7  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
236 aa  91.3  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  37.1 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 
199 aa  89  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
192 aa  89  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 
235 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  38.89 
 
 
188 aa  88.6  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 
234 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
234 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  47.86 
 
 
222 aa  88.2  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  41.14 
 
 
189 aa  87.8  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  41.42 
 
 
181 aa  85.5  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
216 aa  85.1  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
234 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
222 aa  84  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4026  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62673  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  31.69 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  36.02 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 
216 aa  82  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
150 aa  82  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2111  TetR family transcriptional regulator  45.6 
 
 
188 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.0160657 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  36.13 
 
 
222 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
193 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
234 aa  78.2  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3499  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553383  normal  0.3226 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4571  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281671  normal  0.592331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  38.51 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  34.3 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  37.99 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  38.1 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4769  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  64.52 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_003296  RS03880  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.431523 
 
 
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NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0292147 
 
 
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NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  34.32 
 
 
228 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
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NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.943089 
 
 
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NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
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