More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4572 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  474  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  72.43 
 
 		 231 aa  323  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  51.74 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  47.73 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 210 aa  99.4  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 203 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 203 aa  89  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 203 aa  89  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 257 aa  85.5  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 207 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  38.65 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 218 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 200 aa  72  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  35.4 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 200 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  34.62 
 
 		 190 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  29.11 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  28.34 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 333 aa  62  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  21.98 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  29.52 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  29.81 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  30.82 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>