More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0440 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 203 aa  176  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 203 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  31.07 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  30.26 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 185 aa  62  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  29.38 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  24.76 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0069  putative transcriptional regulator  27.11 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.494217  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  29.8 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  25.55 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3165  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  29.3 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  21.88 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  22.78 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  27.43 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2454  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1668  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  32.09 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>