More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1653 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  65.02 
 
 		 307 aa  301  9e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  62.61 
 
 		 333 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 214 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 204 aa  119  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 202 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 203 aa  111  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 203 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  38.34 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  33.88 
 
 		 199 aa  96.3  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 215 aa  95.5  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 203 aa  95.5  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 199 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  33.86 
 
 		 199 aa  85.9  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 203 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  31.67 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 197 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  33.72 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 197 aa  72  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  31.46 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  30.27 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  28.98 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 208 aa  62  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  27.93 
 
 		 228 aa  62  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 208 aa  62  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1003  putative HTH-type transcriptional regulator  27.18 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 98 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  24.26 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
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NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
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NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  29.89 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
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NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
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NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  29.68 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 200 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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