More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1331 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  397  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 193 aa  72  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  34.34 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  32.64 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  32.73 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0641  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  46.07 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  31.45 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6157  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6450  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  30.41 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  32.1 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 		 307 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5105  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  25.15 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  26.05 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  34.56 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  39.81 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>