More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3297 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  56.12 
 
 		 227 aa  92.8  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 214 aa  74.3  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  47.44 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 213 aa  64.3  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 770 aa  63.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  48.57 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 234 aa  62  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 218 aa  62  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 271 aa  60.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 225 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 210 aa  60.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 333 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 307 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 209 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 251 aa  57  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 234 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 233 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 214 aa  57  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 207 aa  57  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  41.07 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  45 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  45.16 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 393 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0588  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 276 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
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NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
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NC_002967  TDE1114  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  48.08 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
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