More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1957 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 216 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 215 aa  104  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  35.2 
 
 		 204 aa  101  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 209 aa  94.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 236 aa  92  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  29.19 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1210  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0313613  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4369  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  31.43 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 330 aa  61.6  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  32.26 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  43.37 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3117  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  44.64 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  34.86 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  30 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  38.71 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 273 aa  54.3  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 228 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  33.33 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  35.14 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 393 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 424 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 224 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>