More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3170 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 216 aa  435  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  52.2 
 
 		 211 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 211 aa  218  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  50.73 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  51.71 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 211 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 211 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  50.24 
 
 		 211 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 212 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 230 aa  88.6  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2667  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 196 aa  72  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.182644  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2716  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0607966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2924  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2923  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.30016e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2963  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2934  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  31.25 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  50 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 307 aa  65.1  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  34.26 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  50 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  29.69 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24360  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0743  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.803231 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>