More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24360 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_24360  transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  56.83 
 
 		 205 aa  232  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0384  transcriptional regulator, TetR family  41.34 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  38.73 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 332 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  33.87 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1329  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000000704239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1044  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000181846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2963  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 125 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2716  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0607966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2924  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2923  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.30016e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  36.23 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2667  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.182644  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 245 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2934  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2148  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 256 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 226 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 226 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 226 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  41.51 
 
 		 260 aa  51.6  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  36.23 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2188  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106219  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.77 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 280 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 310 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0375  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00856394  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  34.92 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2016  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 190 aa  49.3  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 244 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0168  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 248 aa  48.9  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  36.92 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>