214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4314 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  428  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  81.95 
 
 		 213 aa  348  4e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  77.07 
 
 		 211 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  77.07 
 
 		 211 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  77.07 
 
 		 211 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  51.78 
 
 		 226 aa  193  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1035  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168916  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1159  regulatory protein, TetR  38.96 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 291 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24360  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3129  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.534094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  25.75 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 241 aa  49.3  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 191 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 191 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 191 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5811  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 332 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2656  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0956  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 125 aa  45.4  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 181 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 231 aa  45.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 235 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 184 aa  45.4  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  36 
 
 		 184 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4350  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 225 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 244 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  26 
 
 		 181 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5031  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 258 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201359  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1257  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5829  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 258 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1274  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.941811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1283  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20735  normal  0.25464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>