More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_47240 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  98.04 
 
 		 204 aa  403  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  53.89 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  53.16 
 
 		 206 aa  196  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  49.7 
 
 		 237 aa  174  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 207 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 205 aa  134  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  61.36 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  46.27 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 291 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 497 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 398 aa  57  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 289 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  62.79 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2097  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191848  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>