More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5185 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  99.06 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  88.63 
 
 		 212 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  65.26 
 
 		 222 aa  244  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  60.82 
 
 		 206 aa  229  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  53.12 
 
 		 204 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  52.6 
 
 		 204 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 230 aa  72  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  23.21 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  22.62 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  34.69 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  35 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5409  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394363  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2128  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.544484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  28.28 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  39.44 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  37 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 260 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 446 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 257 aa  52  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  32.22 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 231 aa  51.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3165  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 243 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>