More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28300 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  100 
 
 		 280 aa  545  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  53.8 
 
 		 346 aa  192  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  53.48 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 199 aa  89  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 207 aa  89  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 207 aa  81.6  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  37.09 
 
 		 223 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  30.45 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 203 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  35.17 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  34.21 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 226 aa  68.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  58.18 
 
 		 208 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  46.15 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  37.9 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 211 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  34.4 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  40.79 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 218 aa  62  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 199 aa  62  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 217 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 202 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  35.97 
 
 		 197 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  46.58 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  46.38 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  33.88 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  45.83 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  48.44 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  31.03 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 198 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  48.21 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  28 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  36.14 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1640  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>