More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2601 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  86.61 
 
 		 224 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 229 aa  222  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 183 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  45.13 
 
 		 197 aa  164  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  41.71 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 215 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 200 aa  155  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 		 204 aa  148  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 197 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  38.34 
 
 		 216 aa  138  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  31.61 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 224 aa  72  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  29.69 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4158  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 445 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2587  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2548  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2593  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
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NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  29.33 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 202 aa  62  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 197 aa  62  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  36.28 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  27.72 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2164  regulatory protein, TetR  26.15 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  26.89 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
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NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  40.26 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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