More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0024 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  433  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  88.63 
 
 		 212 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  88.63 
 
 		 212 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  88.63 
 
 		 212 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  63.08 
 
 		 222 aa  248  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  61.98 
 
 		 206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  53.89 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  53.89 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 237 aa  165  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 207 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  36.5 
 
 		 205 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5409  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394363  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  29.03 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 446 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  25.34 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  33.98 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  33.96 
 
 		 258 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>