More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0228 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.27 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  29.22 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  29.22 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  20.83 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  40.35 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  22.45 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 497 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  32.95 
 
 		 278 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  27.43 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  43.86 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 179 aa  52.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  20.62 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  42.31 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 248 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>