More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11567 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  442  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  46.05 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2788  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  29.86 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2754  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.864254  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  30.09 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  52.94 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  29.47 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  27.35 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2368  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 197 aa  62  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000142624 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 212 aa  62  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2767  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.430405  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  42.39 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  33.64 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2809  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167328  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  40.68 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 291 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  41.27 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>