More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2788 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_2788  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  418  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  93.1 
 
 		 203 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2754  TetR family transcriptional regulator  93.1 
 
 		 203 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.864254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  91.63 
 
 		 203 aa  387  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  92.12 
 
 		 203 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  91.13 
 
 		 203 aa  384  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2767  transcriptional regulator, TetR family  88.67 
 
 		 203 aa  374  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.430405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  89.16 
 
 		 203 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2809  transcriptional regulator, TetR family  86.7 
 
 		 203 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2560  TetR family transcriptional regulator  83.74 
 
 		 203 aa  350  8e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.282393  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  28.78 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  23.44 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  22.83 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0956  TetR family transcriptional regulator  18.46 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  22 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 250 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 241 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  24.07 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 217 aa  51.2  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  22.92 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  22.92 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  21.46 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  22.4 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  22.4 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  22.84 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1866  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  24.46 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  23.28 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  22.91 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  22.91 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 237 aa  48.1  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 222 aa  48.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  22.91 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>