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for query gene Sfri_0936 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  100 
 
 		 206 aa  424  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 201 aa  248  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  62.57 
 
 		 202 aa  247  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  60.51 
 
 		 200 aa  246  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  62.57 
 
 		 202 aa  245  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  63.1 
 
 		 201 aa  245  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 189 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 190 aa  245  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  63.1 
 
 		 201 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  62.7 
 
 		 190 aa  242  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  60.96 
 
 		 202 aa  239  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  61.41 
 
 		 191 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  54.15 
 
 		 205 aa  228  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  58.38 
 
 		 193 aa  226  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  56.22 
 
 		 194 aa  224  9e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  56.28 
 
 		 194 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 195 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
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NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 197 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
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NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
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NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 190 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
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NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
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NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0243  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4747  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5292  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.505597 
 
 
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NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4864  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.935636  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_5456  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5406  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313854  normal  0.0102978 
 
 
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NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 188 aa  62  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
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NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
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NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
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NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  45 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  25.53 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  26.98 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
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NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  25.69 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
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NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
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NC_013171  Apre_0547  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
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