More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4326 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  94.12 
 
 		 188 aa  362  3e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 213 aa  234  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  57.07 
 
 		 188 aa  226  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 203 aa  216  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  50.8 
 
 		 198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  39.01 
 
 		 193 aa  131  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  39.01 
 
 		 194 aa  125  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  32.8 
 
 		 191 aa  92  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 190 aa  84.7  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5422  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  29.17 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  23.24 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3455  regulatory protein TetR  23.28 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  0.0784455 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  30.6 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  23.24 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  31.63 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0066  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 245 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  35.14 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 307 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  41.82 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  45.1 
 
 		 278 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0676  putative transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>