More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2371 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 190 aa  390  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  96.84 
 
 		 190 aa  374  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  60.42 
 
 		 192 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  61.78 
 
 		 191 aa  241  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  58.12 
 
 		 191 aa  230  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  57.07 
 
 		 203 aa  225  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 189 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  52.06 
 
 		 194 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  31.91 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  33.16 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 198 aa  95.9  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 199 aa  93.6  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 203 aa  90.9  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 197 aa  85.9  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  30.26 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3455  regulatory protein TetR  23.9 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  0.0784455 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2309  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.160392  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0243  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  26.4 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 210 aa  57  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  20.59 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 242 aa  53.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5456  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5406  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313854  normal  0.0102978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4864  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.935636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>