145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5422 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5422  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3455  regulatory protein TetR  33 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  0.0784455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3964  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  29.87 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  34.74 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0066  transcriptional regulator  40 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 198 aa  51.2  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  29.21 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  24.08 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  19.81 
 
 		 234 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  45.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  40.3 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 190 aa  45.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 223 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 223 aa  45.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 193 aa  44.7  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  30.21 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2408  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3099  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3735  TetR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1945  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 227 aa  42.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  28.83 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 235 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0354  hypothetical protein  26.12 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0313675 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>