More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5008 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
201 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  77.89 
 
 
199 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  43.78 
 
 
203 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 
198 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 
199 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 
191 aa  104  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  41.52 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2851  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 
204 aa  96.3  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 
205 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 
214 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  37.29 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  34.55 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  30.77 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
194 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  32.37 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 
214 aa  64.7  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
235 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  54.69 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
231 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
189 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 
194 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
214 aa  62.4  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 
201 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
207 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 
216 aa  61.6  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 
228 aa  61.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 
191 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  29.06 
 
 
226 aa  60.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 
191 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
207 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
242 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
383 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4255  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
216 aa  60.1  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
209 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
237 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
231 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 
212 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
206 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>