268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0061 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
224 aa  437  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  43.23 
 
 
222 aa  129  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
191 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  35.84 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
199 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 
204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 
191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 
214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  38.04 
 
 
211 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
194 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
194 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
215 aa  105  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 
198 aa  104  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 
193 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
194 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 
205 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
200 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
203 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  38.8 
 
 
192 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 
228 aa  99.4  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
193 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 
217 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  35.84 
 
 
231 aa  97.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
200 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
383 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
287 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 
208 aa  95.9  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
200 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
187 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
200 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
200 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
237 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
192 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  38.29 
 
 
214 aa  91.7  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  33.52 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
200 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
200 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
200 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 
199 aa  88.2  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 
194 aa  88.2  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
199 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 
199 aa  88.2  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0492  TetR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.496213  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
199 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  39.75 
 
 
178 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  38.15 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 
194 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  38.96 
 
 
266 aa  85.1  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  31.16 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 
202 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1821  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
199 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  31.05 
 
 
224 aa  82  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 
202 aa  82  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  31.36 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  36.14 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 
200 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
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NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
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NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0854341 
 
 
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NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 
193 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
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NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal 
 
 
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NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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