More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2332 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  100 
 
 
204 aa  410  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  61.66 
 
 
199 aa  224  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  56.92 
 
 
237 aa  214  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  53.37 
 
 
199 aa  200  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  51.28 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  43.46 
 
 
210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  43.72 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  39.56 
 
 
182 aa  108  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 
202 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
192 aa  104  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
191 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
209 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 
205 aa  101  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 
194 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 
234 aa  99.8  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
217 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 
201 aa  99  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 
200 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 
199 aa  91.3  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  37.1 
 
 
191 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
191 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
191 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
191 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 
230 aa  88.6  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
191 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
197 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 
228 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
200 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
200 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
200 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  39.49 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  35.08 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  32.82 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 
203 aa  79  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 
187 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 
191 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  34.84 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  37.35 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3001  transcriptional regulator, TetR family  42.34 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  32.48 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  42.99 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 
212 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
231 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
200 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  26.94 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  41.3 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  43.52 
 
 
185 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  35.95 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  32.2 
 
 
194 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal 
 
 
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NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
189 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.412295 
 
 
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NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
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NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
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